Pembangunan Tahap I dikerjakan oleh Kementerian Agama, terdiri dari tiga paket yaitu pembangunan gedung rektorat, gedung fakultas A (Fakultas Kajian Islam, Pendidikan, dan Ilmu Sosial Humaniora), dan Kawasan Tiga Pilar (Masjid dan Perpustakaan di areal tengah kampus).
Tahap II pembangunan Kampus UIII dikerjakan oleh Kementerian PUPR meliputi Gedung Perpustakaan Pusat sebanyak 8 lantai seluas 16.556 m2 dengan kapasitas, pengunjung 1.000 orang, apartemen mahasiswi, dan masjid kampus 2 lantai seluas 5200 m2 dengan kapasitas tampung 1.880 jamaah.
Kemudian, pembangunan Perpustakaan Pusat 8 lantai seluas 16.556 m2 dengan kapasitas pengunjung 1.000 orang dan pembangunan apartemen bagi mahasiswi Blok I seluas 12.615m2 yang terdiri dari 8 lantai dengan jumlah kamar 268 unit.
Tahap III pembangunan kampus UIII dilaksanakan oleh Kementerian PUPR yang terdiri dari pembangunan Gedung Fakultas B setinggi 4 lantai seluas 14.590 m2, perumahan dosen 10 unit, dan Tempat Pengolahan Sampah Reduce Reuse Recycle (TPS3R).
Pada Tahun Anggaran 2021/2022, dibuka 4 fakultas, yaitu, Faculty of Islamic Studies, Faculty of Economics and Business, Faculty of Social Sciences, dan Faculty of Education. Sedangkan pada Tahun Anggaran 2022/2023 akan dibuka 3 fakultas baru, yakni Faculty of Law, Faculty of Sciences and Technology, serta Faculty of Arts and Design.
Tiap fakultas memiliki dua prodi, yaitu Magister dan Doktor. Penambahan prodi dimungkinkan sesuai kebutuhan dan kesiapan.
Penerimaan mahasiswa baru
UIII membuka pendaftaran calon mahasiswa baru melalui program UIII Scholarship. Program ini terbuka untuk calon mahasiswa dari dalam maupun luar negeri.Pendaftaran dibuka mulai 7 Juni 2021 sampai 14 Juli 2021 dengan jumlah pelamar mencapai 1.009 orang. Mereka berasal dari 59 negara dengan komposisi 45 persen persen berasal dari Indonesia dan 55 persen dari mancanegara. Yakni Kanada, Arab Saudi, Mesir, Senegal, serta beberapa negara asia lainnya, termasuk Malaysia dan Singapura.
