Dengan salah satu fasilitas pengurutan terbesar di dunia, lembaga yang berbasis di Inggris ini telah membaca lebih dari 48 petabase — atau 48 pasangan basa kuadriliun — dari urutan DNA dan RNA untuk mengungkap wawasan penting tentang kesehatan dan penyakit.
Program Cancer, Ageing and Somatic Mutation (CASM) mengurutkan dan menganalisis puluhan ribu genom kanker per tahun untuk mempelajari proses mutasi yang mendorong pembentukan kanker, serta variasi genetik yang menentukan efektivitas pengobatan.
Untuk mengatasi inisiatif skala besar seperti itu, Sanger Institute sedang mengeksplorasi penggunaan sistem DGX dengan Parabricks, rangkaian perangkat lunak analisis genomik yang dapat diskalakan yang memanfaatkan komputasi yang dipercepat untuk memproses data hanya dalam hitungan menit.
"Sanger Institute menangani ratusan ribu sampel somatik setiap tahun," kata Jingwei Wang, pengembang perangkat lunak utama untuk CASM di Wellcome Sanger Institute. "Komputasi yang dipercepat NVIDIA dan Parabricks akan menghemat banyak waktu, biaya, dan energi saat menganalisis sampel, dan kami sangat senang untuk mengeksplorasi arsitektur canggih NVIDIA, seperti NVIDIA Grace dan Grace Hopper, untuk performa dan efisiensi yang lebih tinggi."
Mengurangi Runtime dan Konsumsi Energi
Institut Sanger mengembangkan model sampel kanker throughput tinggi untuk skrining fungsional genom dan pengujian obat. Komputasi dan perangkat lunak yang dipercepat NVIDIA secara drastis mengurangi runtime analisis institut dan konsumsi energi per genom.
Untuk mempercepat analisis genomik dengan Burrows-Wheeler Aligner (BWA), paket perangkat lunak untuk memetakan urutan DNA terhadap genom referensi besar, Sanger menggunakan alur kerja CaVEMan miliknya yang berjalan pada CPU dan memanfaatkan Parabricks pada GPU NVIDIA.
Lembaga ini mengurangi runtime 1,6x, biaya 24x dan konsumsi energi hingga 42x — menggunakan satu sistem NVIDIA DGX dibandingkan dengan 128 server CPU dual-socket.
Sekitar 125 juta jam CPU dikonsumsi per 10.000 genom yang diurutkan oleh institut setiap tahun. Ini berarti bahwa Sanger Institute dapat, setiap tahun, menghemat $ 1 juta dan 1.000 megawatt-jam dengan beralih menggunakan BWA dengan Parabrick pada GPU. Itu tentang jumlah energi yang dibutuhkan untuk memberi daya pada rata-rata rumah Amerika selama satu abad.
Laboratorium pengurutan yang dipercepat NVIDIA dari Sanger Institute dapat dianggap sebagai pabrik AI, di mana data masuk dan kecerdasan keluar. Pabrik AI adalah pusat data generasi berikutnya yang menampung platform komputasi akselerasi full-stack canggih untuk tugas komputasi yang paling intensif.
Saat mengeksplorasi pertanyaan ilmiah penting untuk menemukan gen kanker baru dan proses mutasi, Sanger Institute meningkatkan efisiensi operasional dan energi dengan menggunakan infrastruktur NVIDIA untuk pabrik AI-nya.
Selain itu, perusahaan dan organisasi yang membangun pabrik AI berpartisipasi dalam kolaborasi lintas industri dengan para pemimpin seperti Schneider Electric, perusahaan manajemen energi dan otomasi, untuk mengoptimalkan desain pusat data untuk menjalankan beban kerja yang menuntut dengan cara yang paling hemat energi.
Sanger Institute berkolaborasi dengan Schneider Electric untuk meminimalkan waktu henti pusat data dan melengkapi pusat data laboratorium pengurutan DNA dengan catu daya dan peralatan pendingin yang tidak terputus, di antara teknologi lain yang sangat penting untuk mengurangi konsumsi energi.
Pada konferensi GTC pada bulan Maret, Schneider Electric mengumumkan bahwa mereka membantu organisasi di seluruh industri mengoptimalkan infrastruktur dengan merilis desain referensi pusat data AI yang disesuaikan untuk klaster komputasi yang dipercepat NVIDIA.
Desain referensi — dibangun untuk pemrosesan data, simulasi teknik, otomatisasi desain elektronik, desain obat berbantuan komputer, dan AI generatif — akan fokus pada distribusi daya tinggi, sistem pendingin cairan, dan aspek lain dari pusat data yang dapat diskalakan, berkinerja tinggi, dan berkelanjutan.
Cek Berita dan Artikel yang lain di
Google News
Viral! 18 Kampus ternama memberikan beasiswa full sampai lulus untuk S1 dan S2 di Beasiswa OSC. Info lebih lengkap klik : osc.medcom.id
